Do zadań Laboratorium Badania Wody i Gleby należy:
1) prowadzenie badań fizykochemicznych i mikrobiologicznych:
a) wody przeznaczonej do spożycia przez ludzi,
b) wody surowej,
c) wód konfekcjonowanych,
d) wód powierzchniowych (kąpieliska morskie i śródlądowe),
e) wody z pływalni,
2)Prowadzenie badań mikrobiologicznych i helmintologicznych:
a) gleby,
b) osadów ściekowych,
c) ścieków,
3) udział w opracowywaniu analiz stanu sanitarnego wód i gleby;
4) wdrażanie nowych metod badań;
5) udział w badaniach biegłości i porównaniach międzylaboratoryjnych.